Kaito adalah anggota dari keluarga ninja yang terkenal, yang dikenal sebagai "Kaze no Ninja" (Ninja Angin). Sejak kecil, Kaito dilatih oleh ayahnya, yang merupakan pemimpin keluarga ninja tersebut, untuk menjadi seorang ninja yang tangguh dan setia.
Kaito harus membuat pilihan yang sulit dan menggunakan kemampuan ninja-nya untuk menghancurkan musuh-musuh Nobunaga dan mengklarifikasi rahasia-rahasia yang tidak terpecahkan. Dalam proses tersebut, dia akan menemukan kekuatan dan kelemahannya sendiri, serta memahami arti sebenarnya dari loyalitas dan pengorbanan.
Berikut adalah cerita untuk "Nobunaga no Shinobi Sub Indo Top":
Suatu hari, Kaito dan keluarganya diserang oleh sekelompok ninja lain yang dipimpin oleh seorang ninja jahat bernama Akane. Dalam pertempuran tersebut, Kaito dan ayahnya berhasil melarikan diri, namun keluarga mereka hancur dan reputasi mereka sebagai ninja ternoda.
Kaito yang merasa dendam dan bersalah, memutuskan untuk meninggalkan keluarganya dan mencari perlindungan di bawah pimpinan Oda Nobunaga, seorang daimyo (penguasa feodal) yang kuat dan ambisius.
Bagaimana? Apakah cerita ini dapat menjadi inspirasi untuk "Nobunaga no Shinobi Sub Indo Top"?
Namun, ketika Kaito semakin dekat dengan Nobunaga dan anak buahnya, dia mulai menyadari bahwa ada sesuatu yang tidak beres dengan Nobunaga. Nobunaga yang terlihat seperti seorang pemimpin yang kuat dan bijak, ternyata memiliki sisi gelap yang tidak diketahui banyak orang.
Nobunaga no Shinobi: Kaze no Stigma